Między Śródmieściem a południem
Północna część Mokotowa pozostaje bezpośrednio związana ze Śródmieściem, natomiast rejony położone dalej na południe przechodzą w stronę Ursynowa i Wilanowa. Zachodnia granica prowadzi ku Ochocie i Włochom, a wschodni skraj dzielnicy dochodzi do Wisły.
Aleja Niepodległości, Puławska, Sobieskiego, Czerniakowska i aleja Wilanowska rozprowadzają ruch pomiędzy różnymi częściami Mokotowa oraz sąsiednimi dzielnicami.
Linia metra przebiegająca przez centralną część dzielnicy łączy Mokotów ze Śródmieściem i Ursynowem. Trasy tramwajowe oraz autobusowe uzupełniają przejazdy w kierunku Ochoty, Wilanowa i dolnego Mokotowa.
Rozległość Mokotowa sprawia, że poszczególne rejony mają odmienne powiązania miejskie. Służew jest bliżej Ursynowa i Włoch, Sadyba pozostaje związana z Wilanowem, a Stary Mokotów z centralnymi obszarami Warszawy.
Północny Mokotów
Stary Mokotów sąsiaduje ze Śródmieściem i pozostaje częścią zwartej, centralnej zabudowy Warszawy. Puławska oraz aleja Niepodległości prowadzą bezpośrednio w stronę centrum.
Południowe sąsiedztwo
Służew, Stegny i Sadyba leżą przy trasach prowadzących do Ursynowa i Wilanowa. Aleja Wilanowska oraz Sobieskiego tworzą główne osie tej części dzielnicy.
Rejony nad Wisłą
Czerniaków i Siekierki zajmują wschodnią część Mokotowa. Czerniakowska oraz Trasa Siekierkowska łączą ten obszar z centrum i prawobrzeżną Warszawą.
Centrum, zachód i południe
Najbliższe relacje Mokotowa obejmują dzielnice położone wzdłuż głównych tras lewego brzegu. Kierunki te łączą centrum, obszary biurowe, rejony mieszkaniowe oraz południowe krańce miasta.
Dzielnice po obu stronach Wisły
Trasa Siekierkowska, mosty oraz centralne ulice Warszawy prowadzą z Mokotowa do dzielnic prawego brzegu i północnych obszarów miasta.
Różne części jednej dzielnicy
Mokotów nie tworzy jednego zwartego układu lokalnego. Północne rejony funkcjonują blisko centrum, zachodnie obszary są powiązane z Ochotą i Włochami, a południowa część dzielnicy otwiera się w stronę Ursynowa oraz Wilanowa.
Położenie pomiędzy Śródmieściem, Wisłą i południowymi granicami zwartej zabudowy nadaje Mokotowowi ważne miejsce w sieci przejazdów obejmującej całą Warszawę.